Punktem wyjścia dla obliczenia stawek jest obliczenie kosztów funkcjonowania całego systemu.

Został on oszacowany na podstawie, m.in.:

• szacunku kosztów odbioru i zagospodarowania odpadów dokonanego między innymi na podstawie informacji składanych przez firmy realizujące takie usługi,
• prognoz dot. zmiany ilości produkowanych odpadów,
• kosztów utrzymania i eksploatacji EKOPORTÓW (Punktów zbiórki odpadów problemowych),
• kosztów obsługi administracyjnej systemu.

Dla oszacowania stawek posłużyły też dane Zakładu Wodociągów i Kanalizacji dotyczące zużycia wody na terenie Szczecina na przestrzeni ostatnich lat.